Interest in the artificial synthesis of peptides designed to identify and even simulate different biological targets is not new. These peptides, and molecules with which they interact, are important for biological research and interesting for medical and pharmaceutical fields, although the cost of this work would rule out detailed analysis and progress in this field.
The PEPCHIPOMICS project team, funded under the Seventh Framework Programme for Research and Technological Development (FP7) of the European Union, hopes to provide a solution. The project was created to synthesize and prepare peptide microarrays high density.
The work done in the project has led PEPCHIPOMICS the design of a new high-performance platform which integrates the synthesis, detection and analysis of peptides to an unprecedented scale. This microarray technology is capable of synthesizing two million different peptides on a slide of a postage stamp size, enough to express in the form of overlapping peptides, the fully human proteome, that is, the set of proteins expressed by a genome, a cell tissue or organism.
Professor Søren Buus, University of Copenhagen and project coordinator, said: "This technology allows us to represent sets of large proteins, such as the complete human proteome in a single slide. It also allows smaller joint study, single entities even in great detail using multiple isolated peptide variants. The cost of these experiments was prohibitive and hitherto was very complex organization concerned. How do you record such one hundred thousand targets and results extracted? Henceforth this work will be cheaper and easier to manage. Scientists and companies thus have a comprehensive approach based on peptides (eg representing the whole proteome) for use in studies designed to find interesting targets for science and new drug candidates. "
A few months ago, the project achieved significant progress in discovering the possibility of synthesizing more than one hundred thousand peptides in parallel and also detect the interaction of "other molecules". His research demonstrated the ability to interpret the resulting data and identify what they recognize such molecules.
"This is only the beginning, said the teacher-Buus, the next step is to integrate the peptide microarray technology with powerful without markup technologies can detect real-time interaction between the chip and the remaining peptide molecules exposed to the chip . This may be further specified the association and dissociation constants and the strength of the interaction, important parameters for biotechnological fields, doctor and pharmacist. This could even identify which molecules interact with peptides. "
The ability to manipulate peptide to a level similar to that achieved with the recent genomic revolution could impact heavily on the methods employed in the future to respond to various scientific and clinical issues and how to solve the problems facing the biotechnology and pharmaceutical science.
Las moléculas de proteína presente en todas las células y tejidos en el cuerpo, particularmente despertado interés científico como son una parte esencial de la mayoría de los procesos biológicos. Las proteínas se componen de una cadena de aminoácidos. Cuando la longitud de esta cadena se denominan péptidos cortos.
El interés en la síntesis artificial de péptidos diseñados para identificar e incluso simular diferentes objetivos biológicos no es nuevo. Estos péptidos y moléculas con las que interactúan, son importantes para la investigación biológica e interesante para los campos médicos y farmacéuticos, aunque el costo de este trabajo descartaría análisis detallado y el progreso en este campo.
El equipo del proyecto PEPCHIPOMICS, financiado por el Séptimo Programa Marco de Investigación y Desarrollo Tecnológico (7PM) de la Unión Europea, pretende ofrecer una solución. El proyecto fue creado para sintetizar y preparar microarrays de péptidos de alta densidad.
El trabajo realizado en el proyecto se ha llevado PEPCHIPOMICS el diseño de una nueva plataforma de alto rendimiento que integra la síntesis, la detección y el análisis de péptidos a una escala sin precedentes. Esta tecnología de microarrays es capaz de sintetizar dos millones péptidos diferentes sobre un portaobjetos de un tamaño sello de correos, suficiente para expresar en forma de péptidos solapantes, el proteoma completamente humana, es decir, el conjunto de proteínas expresadas por un genoma, un tejido de células o un organismo.
Profesor Søren Buus de la Universidad de Copenhague y coordinador del proyecto, dijo: "Esta tecnología nos permite representar conjuntos de proteínas de gran tamaño, como el proteoma humano completo en una sola diapositiva También permite a los pequeños estudios conjuntos, entidades individuales incluso en gran detalle usando. múltiples variantes peptídicas aisladas. El costo de estos experimentos era prohibitivo y hasta ahora era una organización muy compleja cuestión. ¿Cómo registrar esos cien mil objetivos y los resultados extraídos? En adelante este trabajo será más barato y más fácil de manejar. científicos y las empresas tienen así una enfoque integral basado en péptidos (por ejemplo, representa el proteoma completo) para su uso en estudios diseñados para encontrar objetivos interesantes para la ciencia y nuevos candidatos a fármacos ".
Hace unos meses, el proyecto ha logrado un progreso significativo en el descubrimiento de la posibilidad de sintetizar más de cien mil péptidos en paralelo y también detectar la interacción de "otras moléculas". Su investigación demostró la capacidad de interpretar los datos obtenidos e identificar lo que reconocen dichas moléculas.
"Esto es sólo el principio, dijo el profesor-Buus, el siguiente paso es la integración de la tecnología de microarrays de péptidos con potentes tecnologías sin marcas puede detectar interacción en tiempo real entre el chip y las moléculas peptídicas que quedan expuestos al chip. Esto puede ser especifica además la asociación y de las constantes de disociación y la fuerza de la interacción, los parámetros importantes para los campos de la biotecnología, médico y farmacéutico. Esto podría incluso identificar moléculas que interactúan con péptidos ".
La capacidad de manipular péptido a un nivel similar al alcanzado con la revolución genómica reciente podría afectar en gran medida de los métodos utilizados en el futuro para responder a diversas cuestiones científicas y clínicas y la forma de resolver los problemas que enfrenta la biotecnología y la ciencia farmacéutica.
Links:
PEPCHIPOMICS:
http://pepchipomics.ku.dk/
Universidad de Copenhague:
http://www.ku.dk/english
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